Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WR25

Gm28360, Predicted gene 28360, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28360A0A087WR25 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm28360A0A087WR25 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm28360A0A087WR25 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Gm28360A0A087WR25 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm28360A0A087WR25 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm28360A0A087WR25 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm28360A0A087WR25 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm28360A0A087WR25 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm28360A0A087WR25 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm28360A0A087WR25 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm28360A0A087WR25 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm28360A0A087WR25 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm28360A0A087WR25 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm28360A0A087WR25 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm28360A0A087WR25 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm28360A0A087WR25 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gm28360A0A087WR25 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm28360A0A087WR25 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm28360A0A087WR25 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm28360A0A087WR25 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm28360A0A087WR25 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm28360A0A087WR25 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm28360A0A087WR25 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm28360A0A087WR25 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm28360A0A087WR25 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm28360A0A087WR25 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm28360A0A087WR25 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm28360A0A087WR25 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm28360A0A087WR25 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm28360A0A087WR25 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm28360A0A087WR25 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm28360A0A087WR25 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm28360A0A087WR25 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm28360A0A087WR25 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm28360A0A087WR25 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gm28360A0A087WR25 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gm28360A0A087WR25 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm28360A0A087WR25 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm28360A0A087WR25 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm28360A0A087WR25 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm28360A0A087WR25 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm28360A0A087WR25 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm28360A0A087WR25 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm28360A0A087WR25 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm28360A0A087WR25 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm28360A0A087WR25 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm28360A0A087WR25 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm28360A0A087WR25 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm28360A0A087WR25 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm28360A0A087WR25 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gm28360A0A087WR25 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gm28360A0A087WR25 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm28360A0A087WR25 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm28360A0A087WR25 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm28360A0A087WR25 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm28360A0A087WR25 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm28360A0A087WR25 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm28360A0A087WR25 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm28360A0A087WR25 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm28360A0A087WR25 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm28360A0A087WR25 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm28360A0A087WR25 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm28360A0A087WR25 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm28360A0A087WR25 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm28360A0A087WR25 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm28360A0A087WR25 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm28360A0A087WR25 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm28360A0A087WR25 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm28360A0A087WR25 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm28360A0A087WR25 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm28360A0A087WR25 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm28360A0A087WR25 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm28360A0A087WR25 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm28360A0A087WR25 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm28360A0A087WR25 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm28360A0A087WR25 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm28360A0A087WR25 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm28360A0A087WR25 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm28360A0A087WR25 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm28360A0A087WR25 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm28360A0A087WR25 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm28360A0A087WR25 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm28360A0A087WR25 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm28360A0A087WR25 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm28360A0A087WR25 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm28360A0A087WR25 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm28360A0A087WR25 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm28360A0A087WR25 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm28360A0A087WR25 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm28360A0A087WR25 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm28360A0A087WR25 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm28360A0A087WR25 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm28360A0A087WR25 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm28360A0A087WR25 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm28360A0A087WR25 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm28360A0A087WR25 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm28360A0A087WR25 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm28360A0A087WR25 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm28360A0A087WR25 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm28360A0A087WR25 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
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