Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WR25

Gm28360, Predicted gene 28360, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28360A0A087WR25 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm28360A0A087WR25 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm28360A0A087WR25 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Gm28360A0A087WR25 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm28360A0A087WR25 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm28360A0A087WR25 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm28360A0A087WR25 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm28360A0A087WR25 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm28360A0A087WR25 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm28360A0A087WR25 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm28360A0A087WR25 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm28360A0A087WR25 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm28360A0A087WR25 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm28360A0A087WR25 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm28360A0A087WR25 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm28360A0A087WR25 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gm28360A0A087WR25 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm28360A0A087WR25 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm28360A0A087WR25 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm28360A0A087WR25 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm28360A0A087WR25 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm28360A0A087WR25 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm28360A0A087WR25 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm28360A0A087WR25 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm28360A0A087WR25 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm28360A0A087WR25 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm28360A0A087WR25 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm28360A0A087WR25 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm28360A0A087WR25 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm28360A0A087WR25 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm28360A0A087WR25 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm28360A0A087WR25 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm28360A0A087WR25 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm28360A0A087WR25 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm28360A0A087WR25 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gm28360A0A087WR25 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gm28360A0A087WR25 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm28360A0A087WR25 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm28360A0A087WR25 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm28360A0A087WR25 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm28360A0A087WR25 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm28360A0A087WR25 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm28360A0A087WR25 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm28360A0A087WR25 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm28360A0A087WR25 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm28360A0A087WR25 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm28360A0A087WR25 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm28360A0A087WR25 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm28360A0A087WR25 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm28360A0A087WR25 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gm28360A0A087WR25 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gm28360A0A087WR25 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm28360A0A087WR25 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm28360A0A087WR25 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm28360A0A087WR25 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm28360A0A087WR25 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm28360A0A087WR25 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm28360A0A087WR25 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm28360A0A087WR25 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm28360A0A087WR25 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm28360A0A087WR25 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm28360A0A087WR25 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm28360A0A087WR25 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm28360A0A087WR25 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm28360A0A087WR25 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm28360A0A087WR25 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm28360A0A087WR25 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm28360A0A087WR25 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm28360A0A087WR25 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm28360A0A087WR25 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm28360A0A087WR25 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm28360A0A087WR25 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm28360A0A087WR25 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm28360A0A087WR25 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm28360A0A087WR25 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm28360A0A087WR25 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm28360A0A087WR25 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm28360A0A087WR25 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm28360A0A087WR25 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm28360A0A087WR25 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm28360A0A087WR25 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm28360A0A087WR25 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm28360A0A087WR25 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm28360A0A087WR25 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm28360A0A087WR25 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm28360A0A087WR25 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm28360A0A087WR25 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm28360A0A087WR25 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm28360A0A087WR25 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm28360A0A087WR25 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm28360A0A087WR25 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm28360A0A087WR25 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm28360A0A087WR25 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm28360A0A087WR25 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm28360A0A087WR25 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm28360A0A087WR25 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm28360A0A087WR25 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm28360A0A087WR25 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm28360A0A087WR25 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm28360A0A087WR25 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms