Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQQ0

Gm28557, Predicted gene 28557, mousemouse

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28557A0A087WQQ0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm28557A0A087WQQ0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm28557A0A087WQQ0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm28557A0A087WQQ0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm28557A0A087WQQ0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm28557A0A087WQQ0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm28557A0A087WQQ0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm28557A0A087WQQ0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm28557A0A087WQQ0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm28557A0A087WQQ0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm28557A0A087WQQ0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm28557A0A087WQQ0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm28557A0A087WQQ0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm28557A0A087WQQ0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm28557A0A087WQQ0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm28557A0A087WQQ0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm28557A0A087WQQ0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm28557A0A087WQQ0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm28557A0A087WQQ0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm28557A0A087WQQ0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm28557A0A087WQQ0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm28557A0A087WQQ0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm28557A0A087WQQ0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm28557A0A087WQQ0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm28557A0A087WQQ0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm28557A0A087WQQ0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm28557A0A087WQQ0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm28557A0A087WQQ0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm28557A0A087WQQ0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm28557A0A087WQQ0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm28557A0A087WQQ0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm28557A0A087WQQ0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm28557A0A087WQQ0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm28557A0A087WQQ0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm28557A0A087WQQ0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm28557A0A087WQQ0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm28557A0A087WQQ0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm28557A0A087WQQ0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm28557A0A087WQQ0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm28557A0A087WQQ0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm28557A0A087WQQ0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm28557A0A087WQQ0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm28557A0A087WQQ0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm28557A0A087WQQ0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm28557A0A087WQQ0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm28557A0A087WQQ0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm28557A0A087WQQ0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm28557A0A087WQQ0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm28557A0A087WQQ0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm28557A0A087WQQ0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm28557A0A087WQQ0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm28557A0A087WQQ0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm28557A0A087WQQ0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm28557A0A087WQQ0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm28557A0A087WQQ0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm28557A0A087WQQ0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm28557A0A087WQQ0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm28557A0A087WQQ0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm28557A0A087WQQ0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm28557A0A087WQQ0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm28557A0A087WQQ0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm28557A0A087WQQ0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm28557A0A087WQQ0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm28557A0A087WQQ0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm28557A0A087WQQ0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm28557A0A087WQQ0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm28557A0A087WQQ0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm28557A0A087WQQ0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm28557A0A087WQQ0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm28557A0A087WQQ0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm28557A0A087WQQ0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm28557A0A087WQQ0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm28557A0A087WQQ0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm28557A0A087WQQ0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm28557A0A087WQQ0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm28557A0A087WQQ0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm28557A0A087WQQ0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm28557A0A087WQQ0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm28557A0A087WQQ0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm28557A0A087WQQ0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm28557A0A087WQQ0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm28557A0A087WQQ0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm28557A0A087WQQ0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm28557A0A087WQQ0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm28557A0A087WQQ0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm28557A0A087WQQ0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm28557A0A087WQQ0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm28557A0A087WQQ0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm28557A0A087WQQ0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm28557A0A087WQQ0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm28557A0A087WQQ0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm28557A0A087WQQ0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm28557A0A087WQQ0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gm28557A0A087WQQ0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm28557A0A087WQQ0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm28557A0A087WQQ0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm28557A0A087WQQ0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm28557A0A087WQQ0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm28557A0A087WQQ0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm28557A0A087WQQ0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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