Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0H5

Krt71, Keratin, type II cytoskeletal 71, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt71Q9R0H5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt71Q9R0H5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt71Q9R0H5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt71Q9R0H5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt71Q9R0H5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt71Q9R0H5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt71Q9R0H5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt71Q9R0H5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt71Q9R0H5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt71Q9R0H5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt71Q9R0H5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt71Q9R0H5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt71Q9R0H5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt71Q9R0H5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt71Q9R0H5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt71Q9R0H5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt71Q9R0H5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt71Q9R0H5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt71Q9R0H5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt71Q9R0H5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt71Q9R0H5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt71Q9R0H5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt71Q9R0H5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt71Q9R0H5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt71Q9R0H5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt71Q9R0H5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt71Q9R0H5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt71Q9R0H5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt71Q9R0H5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt71Q9R0H5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt71Q9R0H5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt71Q9R0H5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt71Q9R0H5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt71Q9R0H5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt71Q9R0H5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt71Q9R0H5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt71Q9R0H5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt71Q9R0H5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt71Q9R0H5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt71Q9R0H5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt71Q9R0H5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt71Q9R0H5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt71Q9R0H5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt71Q9R0H5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt71Q9R0H5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt71Q9R0H5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt71Q9R0H5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt71Q9R0H5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt71Q9R0H5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt71Q9R0H5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt71Q9R0H5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt71Q9R0H5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt71Q9R0H5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt71Q9R0H5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt71Q9R0H5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt71Q9R0H5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt71Q9R0H5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt71Q9R0H5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt71Q9R0H5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt71Q9R0H5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt71Q9R0H5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt71Q9R0H5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt71Q9R0H5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt71Q9R0H5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt71Q9R0H5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt71Q9R0H5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt71Q9R0H5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt71Q9R0H5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt71Q9R0H5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt71Q9R0H5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt71Q9R0H5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt71Q9R0H5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt71Q9R0H5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt71Q9R0H5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt71Q9R0H5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt71Q9R0H5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt71Q9R0H5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt71Q9R0H5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt71Q9R0H5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt71Q9R0H5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt71Q9R0H5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt71Q9R0H5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt71Q9R0H5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt71Q9R0H5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt71Q9R0H5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt71Q9R0H5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt71Q9R0H5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt71Q9R0H5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt71Q9R0H5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt71Q9R0H5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt71Q9R0H5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt71Q9R0H5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt71Q9R0H5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt71Q9R0H5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt71Q9R0H5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt71Q9R0H5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt71Q9R0H5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt71Q9R0H5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt71Q9R0H5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt71Q9R0H5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms