Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Cldn19Q9ET38 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Cldn19Q9ET38 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Cldn19Q9ET38 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Cldn19Q9ET38 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
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Cldn19Q9ET38 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
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Cldn19Q9ET38 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn19Q9ET38 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms