Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Irx6Q9ER75 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Irx6Q9ER75 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Irx6Q9ER75 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Irx6Q9ER75 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Irx6Q9ER75 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irx6Q9ER75 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irx6Q9ER75 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irx6Q9ER75 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Irx6Q9ER75 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Irx6Q9ER75 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irx6Q9ER75 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irx6Q9ER75 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Irx6Q9ER75 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irx6Q9ER75 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irx6Q9ER75 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irx6Q9ER75 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irx6Q9ER75 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Irx6Q9ER75 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irx6Q9ER75 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irx6Q9ER75 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irx6Q9ER75 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irx6Q9ER75 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irx6Q9ER75 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Irx6Q9ER75 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irx6Q9ER75 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irx6Q9ER75 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irx6Q9ER75 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irx6Q9ER75 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irx6Q9ER75 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irx6Q9ER75 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Irx6Q9ER75 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irx6Q9ER75 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irx6Q9ER75 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irx6Q9ER75 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irx6Q9ER75 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irx6Q9ER75 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irx6Q9ER75 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irx6Q9ER75 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irx6Q9ER75 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Irx6Q9ER75 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irx6Q9ER75 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irx6Q9ER75 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irx6Q9ER75 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irx6Q9ER75 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irx6Q9ER75 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irx6Q9ER75 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irx6Q9ER75 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irx6Q9ER75 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irx6Q9ER75 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Irx6Q9ER75 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Irx6Q9ER75 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Irx6Q9ER75 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Irx6Q9ER75 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Irx6Q9ER75 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Irx6Q9ER75 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Irx6Q9ER75 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Irx6Q9ER75 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Irx6Q9ER75 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Irx6Q9ER75 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Irx6Q9ER75 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Irx6Q9ER75 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irx6Q9ER75 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Irx6Q9ER75 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irx6Q9ER75 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irx6Q9ER75 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irx6Q9ER75 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Irx6Q9ER75 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irx6Q9ER75 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irx6Q9ER75 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irx6Q9ER75 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irx6Q9ER75 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irx6Q9ER75 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irx6Q9ER75 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Irx6Q9ER75 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Irx6Q9ER75 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irx6Q9ER75 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irx6Q9ER75 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irx6Q9ER75 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irx6Q9ER75 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Irx6Q9ER75 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irx6Q9ER75 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Irx6Q9ER75 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irx6Q9ER75 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irx6Q9ER75 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irx6Q9ER75 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irx6Q9ER75 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irx6Q9ER75 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irx6Q9ER75 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Irx6Q9ER75 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irx6Q9ER75 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Irx6Q9ER75 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irx6Q9ER75 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Irx6Q9ER75 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irx6Q9ER75 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irx6Q9ER75 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irx6Q9ER75 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irx6Q9ER75 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irx6Q9ER75 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Irx6Q9ER75 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms