Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2D9

Klhdc8b, Kelch domain-containing protein 8B, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc8bQ9D2D9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Klhdc8bQ9D2D9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Klhdc8bQ9D2D9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhdc8bQ9D2D9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhdc8bQ9D2D9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhdc8bQ9D2D9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhdc8bQ9D2D9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhdc8bQ9D2D9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhdc8bQ9D2D9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhdc8bQ9D2D9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhdc8bQ9D2D9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhdc8bQ9D2D9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhdc8bQ9D2D9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhdc8bQ9D2D9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhdc8bQ9D2D9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhdc8bQ9D2D9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhdc8bQ9D2D9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhdc8bQ9D2D9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhdc8bQ9D2D9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhdc8bQ9D2D9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhdc8bQ9D2D9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhdc8bQ9D2D9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhdc8bQ9D2D9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhdc8bQ9D2D9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhdc8bQ9D2D9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhdc8bQ9D2D9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhdc8bQ9D2D9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhdc8bQ9D2D9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhdc8bQ9D2D9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhdc8bQ9D2D9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhdc8bQ9D2D9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klhdc8bQ9D2D9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhdc8bQ9D2D9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhdc8bQ9D2D9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhdc8bQ9D2D9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhdc8bQ9D2D9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhdc8bQ9D2D9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhdc8bQ9D2D9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhdc8bQ9D2D9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhdc8bQ9D2D9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhdc8bQ9D2D9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhdc8bQ9D2D9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhdc8bQ9D2D9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhdc8bQ9D2D9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhdc8bQ9D2D9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhdc8bQ9D2D9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klhdc8bQ9D2D9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klhdc8bQ9D2D9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klhdc8bQ9D2D9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klhdc8bQ9D2D9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klhdc8bQ9D2D9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klhdc8bQ9D2D9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klhdc8bQ9D2D9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klhdc8bQ9D2D9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klhdc8bQ9D2D9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klhdc8bQ9D2D9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klhdc8bQ9D2D9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klhdc8bQ9D2D9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klhdc8bQ9D2D9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klhdc8bQ9D2D9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klhdc8bQ9D2D9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Klhdc8bQ9D2D9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klhdc8bQ9D2D9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klhdc8bQ9D2D9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klhdc8bQ9D2D9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klhdc8bQ9D2D9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klhdc8bQ9D2D9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klhdc8bQ9D2D9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klhdc8bQ9D2D9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Klhdc8bQ9D2D9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms