Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU3

Apol9a, Apol9a protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol9aQ8VDU3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Apol9aQ8VDU3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apol9aQ8VDU3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms