Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Q0

Commd9, COMM domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd9Q8K2Q0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Commd9Q8K2Q0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Commd9Q8K2Q0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Commd9Q8K2Q0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Commd9Q8K2Q0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Commd9Q8K2Q0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Commd9Q8K2Q0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms