Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc30Q8BVF4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc30Q8BVF4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc30Q8BVF4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms