Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdcl3Q8BVF2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms