Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grik4Q8BMF5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grik4Q8BMF5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Grik4Q8BMF5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grik4Q8BMF5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grik4Q8BMF5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grik4Q8BMF5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grik4Q8BMF5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grik4Q8BMF5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grik4Q8BMF5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grik4Q8BMF5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grik4Q8BMF5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grik4Q8BMF5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grik4Q8BMF5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grik4Q8BMF5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grik4Q8BMF5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grik4Q8BMF5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grik4Q8BMF5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grik4Q8BMF5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grik4Q8BMF5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grik4Q8BMF5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Grik4Q8BMF5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grik4Q8BMF5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Grik4Q8BMF5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grik4Q8BMF5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grik4Q8BMF5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grik4Q8BMF5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grik4Q8BMF5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grik4Q8BMF5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grik4Q8BMF5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Grik4Q8BMF5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Grik4Q8BMF5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Grik4Q8BMF5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Grik4Q8BMF5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Grik4Q8BMF5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grik4Q8BMF5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grik4Q8BMF5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grik4Q8BMF5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grik4Q8BMF5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grik4Q8BMF5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grik4Q8BMF5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Grik4Q8BMF5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grik4Q8BMF5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grik4Q8BMF5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grik4Q8BMF5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grik4Q8BMF5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grik4Q8BMF5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grik4Q8BMF5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grik4Q8BMF5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grik4Q8BMF5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grik4Q8BMF5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Grik4Q8BMF5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grik4Q8BMF5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grik4Q8BMF5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grik4Q8BMF5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grik4Q8BMF5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grik4Q8BMF5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grik4Q8BMF5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grik4Q8BMF5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Grik4Q8BMF5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grik4Q8BMF5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grik4Q8BMF5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grik4Q8BMF5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grik4Q8BMF5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grik4Q8BMF5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grik4Q8BMF5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grik4Q8BMF5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grik4Q8BMF5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grik4Q8BMF5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grik4Q8BMF5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grik4Q8BMF5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grik4Q8BMF5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grik4Q8BMF5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grik4Q8BMF5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grik4Q8BMF5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grik4Q8BMF5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grik4Q8BMF5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grik4Q8BMF5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grik4Q8BMF5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grik4Q8BMF5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grik4Q8BMF5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grik4Q8BMF5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grik4Q8BMF5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grik4Q8BMF5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grik4Q8BMF5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grik4Q8BMF5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grik4Q8BMF5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grik4Q8BMF5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grik4Q8BMF5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grik4Q8BMF5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grik4Q8BMF5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grik4Q8BMF5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grik4Q8BMF5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grik4Q8BMF5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grik4Q8BMF5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grik4Q8BMF5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grik4Q8BMF5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grik4Q8BMF5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grik4Q8BMF5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grik4Q8BMF5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms