Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg9aQ68FE2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg9aQ68FE2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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