Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Knl1Q66JQ7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Knl1Q66JQ7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Knl1Q66JQ7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Knl1Q66JQ7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Knl1Q66JQ7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Knl1Q66JQ7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Knl1Q66JQ7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Knl1Q66JQ7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Knl1Q66JQ7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Knl1Q66JQ7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Knl1Q66JQ7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Knl1Q66JQ7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Knl1Q66JQ7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Knl1Q66JQ7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Knl1Q66JQ7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Knl1Q66JQ7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Knl1Q66JQ7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Knl1Q66JQ7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Knl1Q66JQ7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Knl1Q66JQ7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Knl1Q66JQ7 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Knl1Q66JQ7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Knl1Q66JQ7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Knl1Q66JQ7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Knl1Q66JQ7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Knl1Q66JQ7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Knl1Q66JQ7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Knl1Q66JQ7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Knl1Q66JQ7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Knl1Q66JQ7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Knl1Q66JQ7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Knl1Q66JQ7 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Knl1Q66JQ7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Knl1Q66JQ7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Knl1Q66JQ7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Knl1Q66JQ7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Knl1Q66JQ7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Knl1Q66JQ7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Knl1Q66JQ7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Knl1Q66JQ7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Knl1Q66JQ7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Knl1Q66JQ7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Knl1Q66JQ7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Knl1Q66JQ7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Knl1Q66JQ7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Knl1Q66JQ7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Knl1Q66JQ7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Knl1Q66JQ7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Knl1Q66JQ7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Knl1Q66JQ7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Knl1Q66JQ7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Knl1Q66JQ7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Knl1Q66JQ7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Knl1Q66JQ7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Knl1Q66JQ7 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Knl1Q66JQ7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Knl1Q66JQ7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Knl1Q66JQ7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Knl1Q66JQ7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Knl1Q66JQ7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Knl1Q66JQ7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Knl1Q66JQ7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Knl1Q66JQ7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Knl1Q66JQ7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Knl1Q66JQ7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Knl1Q66JQ7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Knl1Q66JQ7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Knl1Q66JQ7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Knl1Q66JQ7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Knl1Q66JQ7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Knl1Q66JQ7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Knl1Q66JQ7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Knl1Q66JQ7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Knl1Q66JQ7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Knl1Q66JQ7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Knl1Q66JQ7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Knl1Q66JQ7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Knl1Q66JQ7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Knl1Q66JQ7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Knl1Q66JQ7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Knl1Q66JQ7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Knl1Q66JQ7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Knl1Q66JQ7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Knl1Q66JQ7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Knl1Q66JQ7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Knl1Q66JQ7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Knl1Q66JQ7 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Knl1Q66JQ7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Knl1Q66JQ7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Knl1Q66JQ7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Knl1Q66JQ7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Knl1Q66JQ7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Knl1Q66JQ7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Knl1Q66JQ7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Knl1Q66JQ7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Knl1Q66JQ7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Knl1Q66JQ7 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Knl1Q66JQ7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Knl1Q66JQ7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms