Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI2

Slc44a5, Choline transporter-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a5Q5RJI2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc44a5Q5RJI2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms