Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Nkx6-3Q3UHX8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Nkx6-3Q3UHX8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Nkx6-3Q3UHX8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nkx6-3Q3UHX8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Nkx6-3Q3UHX8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nkx6-3Q3UHX8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Nkx6-3Q3UHX8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Nkx6-3Q3UHX8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nkx6-3Q3UHX8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Nkx6-3Q3UHX8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Nkx6-3Q3UHX8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nkx6-3Q3UHX8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Nkx6-3Q3UHX8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nkx6-3Q3UHX8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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