Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDV8

Zfp444, Zinc finger protein 444, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp444Q3TDV8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfp444Q3TDV8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfp444Q3TDV8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfp444Q3TDV8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfp444Q3TDV8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfp444Q3TDV8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfp444Q3TDV8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfp444Q3TDV8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfp444Q3TDV8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp444Q3TDV8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp444Q3TDV8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp444Q3TDV8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp444Q3TDV8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp444Q3TDV8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp444Q3TDV8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp444Q3TDV8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp444Q3TDV8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp444Q3TDV8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp444Q3TDV8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp444Q3TDV8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp444Q3TDV8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp444Q3TDV8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp444Q3TDV8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp444Q3TDV8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp444Q3TDV8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfp444Q3TDV8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfp444Q3TDV8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfp444Q3TDV8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfp444Q3TDV8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfp444Q3TDV8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfp444Q3TDV8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfp444Q3TDV8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfp444Q3TDV8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfp444Q3TDV8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfp444Q3TDV8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfp444Q3TDV8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfp444Q3TDV8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfp444Q3TDV8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfp444Q3TDV8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfp444Q3TDV8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfp444Q3TDV8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfp444Q3TDV8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Zfp444Q3TDV8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Zfp444Q3TDV8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zfp444Q3TDV8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zfp444Q3TDV8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zfp444Q3TDV8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zfp444Q3TDV8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zfp444Q3TDV8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Zfp444Q3TDV8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zfp444Q3TDV8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zfp444Q3TDV8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zfp444Q3TDV8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zfp444Q3TDV8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zfp444Q3TDV8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfp444Q3TDV8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfp444Q3TDV8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfp444Q3TDV8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfp444Q3TDV8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfp444Q3TDV8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfp444Q3TDV8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfp444Q3TDV8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfp444Q3TDV8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfp444Q3TDV8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfp444Q3TDV8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfp444Q3TDV8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfp444Q3TDV8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfp444Q3TDV8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfp444Q3TDV8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfp444Q3TDV8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfp444Q3TDV8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfp444Q3TDV8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfp444Q3TDV8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfp444Q3TDV8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfp444Q3TDV8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfp444Q3TDV8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfp444Q3TDV8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfp444Q3TDV8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfp444Q3TDV8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfp444Q3TDV8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfp444Q3TDV8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfp444Q3TDV8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfp444Q3TDV8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfp444Q3TDV8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zfp444Q3TDV8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zfp444Q3TDV8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zfp444Q3TDV8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Zfp444Q3TDV8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zfp444Q3TDV8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zfp444Q3TDV8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Zfp444Q3TDV8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Zfp444Q3TDV8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zfp444Q3TDV8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zfp444Q3TDV8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfp444Q3TDV8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfp444Q3TDV8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfp444Q3TDV8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfp444Q3TDV8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfp444Q3TDV8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfp444Q3TDV8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms