Protein–RNA interactions for Protein: P51670

Ccl9, C-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl9P51670 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl9P51670 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms