Protein–RNA interactions for Protein: P50709

Defa11, Alpha-defensin 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa11P50709 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Defa11P50709 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Defa11P50709 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Defa11P50709 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa11P50709 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa11P50709 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Defa11P50709 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa11P50709 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Defa11P50709 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa11P50709 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa11P50709 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa11P50709 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa11P50709 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa11P50709 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa11P50709 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Defa11P50709 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Defa11P50709 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Defa11P50709 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa11P50709 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa11P50709 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa11P50709 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa11P50709 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa11P50709 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa11P50709 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Defa11P50709 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa11P50709 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa11P50709 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa11P50709 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa11P50709 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa11P50709 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa11P50709 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa11P50709 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa11P50709 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa11P50709 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa11P50709 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa11P50709 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa11P50709 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa11P50709 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa11P50709 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa11P50709 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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Defa11P50709 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa11P50709 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa11P50709 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa11P50709 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa11P50709 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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