Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RhoP15409 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RhoP15409 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RhoP15409 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RhoP15409 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RhoP15409 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RhoP15409 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RhoP15409 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RhoP15409 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RhoP15409 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RhoP15409 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RhoP15409 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RhoP15409 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RhoP15409 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RhoP15409 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RhoP15409 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RhoP15409 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RhoP15409 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RhoP15409 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RhoP15409 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RhoP15409 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RhoP15409 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RhoP15409 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RhoP15409 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RhoP15409 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RhoP15409 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RhoP15409 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
RhoP15409 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
RhoP15409 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RhoP15409 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RhoP15409 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RhoP15409 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RhoP15409 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RhoP15409 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RhoP15409 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RhoP15409 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RhoP15409 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RhoP15409 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RhoP15409 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RhoP15409 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RhoP15409 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RhoP15409 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RhoP15409 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RhoP15409 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RhoP15409 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RhoP15409 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RhoP15409 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RhoP15409 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RhoP15409 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RhoP15409 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RhoP15409 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RhoP15409 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RhoP15409 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RhoP15409 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RhoP15409 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RhoP15409 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RhoP15409 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RhoP15409 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RhoP15409 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RhoP15409 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RhoP15409 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RhoP15409 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RhoP15409 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RhoP15409 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RhoP15409 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RhoP15409 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RhoP15409 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RhoP15409 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RhoP15409 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RhoP15409 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RhoP15409 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RhoP15409 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RhoP15409 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RhoP15409 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RhoP15409 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RhoP15409 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RhoP15409 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RhoP15409 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RhoP15409 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RhoP15409 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RhoP15409 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RhoP15409 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RhoP15409 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RhoP15409 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RhoP15409 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RhoP15409 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RhoP15409 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RhoP15409 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RhoP15409 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RhoP15409 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RhoP15409 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RhoP15409 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RhoP15409 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RhoP15409 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RhoP15409 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RhoP15409 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RhoP15409 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RhoP15409 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RhoP15409 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RhoP15409 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms