Protein–RNA interactions for Protein: P09405

Ncl, Nucleolin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NclP09405 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NclP09405 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NclP09405 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NclP09405 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NclP09405 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NclP09405 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NclP09405 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NclP09405 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NclP09405 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NclP09405 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NclP09405 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NclP09405 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NclP09405 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NclP09405 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NclP09405 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NclP09405 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NclP09405 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NclP09405 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NclP09405 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NclP09405 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NclP09405 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NclP09405 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NclP09405 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NclP09405 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NclP09405 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NclP09405 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NclP09405 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NclP09405 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NclP09405 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NclP09405 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NclP09405 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NclP09405 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NclP09405 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NclP09405 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NclP09405 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NclP09405 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NclP09405 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NclP09405 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NclP09405 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NclP09405 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NclP09405 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NclP09405 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NclP09405 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NclP09405 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NclP09405 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NclP09405 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NclP09405 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NclP09405 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NclP09405 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NclP09405 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NclP09405 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NclP09405 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NclP09405 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NclP09405 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NclP09405 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NclP09405 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NclP09405 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NclP09405 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NclP09405 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NclP09405 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NclP09405 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NclP09405 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NclP09405 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NclP09405 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NclP09405 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NclP09405 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NclP09405 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NclP09405 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NclP09405 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NclP09405 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NclP09405 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NclP09405 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NclP09405 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NclP09405 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NclP09405 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NclP09405 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NclP09405 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NclP09405 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NclP09405 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NclP09405 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NclP09405 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NclP09405 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NclP09405 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NclP09405 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NclP09405 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NclP09405 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NclP09405 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NclP09405 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NclP09405 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NclP09405 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NclP09405 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NclP09405 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NclP09405 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NclP09405 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NclP09405 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NclP09405 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NclP09405 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NclP09405 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NclP09405 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NclP09405 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms