Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Efna3O08545 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Efna3O08545 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efna3O08545 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efna3O08545 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efna3O08545 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efna3O08545 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efna3O08545 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Efna3O08545 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Efna3O08545 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Efna3O08545 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms