Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trappc8E9PWG2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trappc8E9PWG2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trappc8E9PWG2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trappc8E9PWG2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trappc8E9PWG2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trappc8E9PWG2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trappc8E9PWG2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trappc8E9PWG2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trappc8E9PWG2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trappc8E9PWG2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trappc8E9PWG2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trappc8E9PWG2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trappc8E9PWG2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trappc8E9PWG2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trappc8E9PWG2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trappc8E9PWG2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trappc8E9PWG2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trappc8E9PWG2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trappc8E9PWG2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trappc8E9PWG2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trappc8E9PWG2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trappc8E9PWG2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trappc8E9PWG2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trappc8E9PWG2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trappc8E9PWG2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Trappc8E9PWG2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Trappc8E9PWG2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms