Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Col9a3A2ACT7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Col9a3A2ACT7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms