Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.2 ms