Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2D9

Klhdc8b, Kelch domain-containing protein 8B, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc8bQ9D2D9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhdc8bQ9D2D9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhdc8bQ9D2D9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhdc8bQ9D2D9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhdc8bQ9D2D9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhdc8bQ9D2D9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhdc8bQ9D2D9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhdc8bQ9D2D9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhdc8bQ9D2D9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhdc8bQ9D2D9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhdc8bQ9D2D9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhdc8bQ9D2D9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhdc8bQ9D2D9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhdc8bQ9D2D9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhdc8bQ9D2D9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhdc8bQ9D2D9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhdc8bQ9D2D9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhdc8bQ9D2D9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhdc8bQ9D2D9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhdc8bQ9D2D9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhdc8bQ9D2D9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhdc8bQ9D2D9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhdc8bQ9D2D9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhdc8bQ9D2D9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhdc8bQ9D2D9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhdc8bQ9D2D9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhdc8bQ9D2D9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhdc8bQ9D2D9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhdc8bQ9D2D9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhdc8bQ9D2D9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhdc8bQ9D2D9 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhdc8bQ9D2D9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhdc8bQ9D2D9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhdc8bQ9D2D9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhdc8bQ9D2D9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhdc8bQ9D2D9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhdc8bQ9D2D9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhdc8bQ9D2D9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhdc8bQ9D2D9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhdc8bQ9D2D9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhdc8bQ9D2D9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhdc8bQ9D2D9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhdc8bQ9D2D9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhdc8bQ9D2D9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhdc8bQ9D2D9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhdc8bQ9D2D9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms