Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dkk4Q8VEJ3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dkk4Q8VEJ3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dkk4Q8VEJ3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dkk4Q8VEJ3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dkk4Q8VEJ3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dkk4Q8VEJ3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dkk4Q8VEJ3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dkk4Q8VEJ3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Dkk4Q8VEJ3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dkk4Q8VEJ3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dkk4Q8VEJ3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Dkk4Q8VEJ3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dkk4Q8VEJ3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dkk4Q8VEJ3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dkk4Q8VEJ3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dkk4Q8VEJ3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dkk4Q8VEJ3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dkk4Q8VEJ3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dkk4Q8VEJ3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dkk4Q8VEJ3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dkk4Q8VEJ3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dkk4Q8VEJ3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dkk4Q8VEJ3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dkk4Q8VEJ3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dkk4Q8VEJ3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dkk4Q8VEJ3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dkk4Q8VEJ3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dkk4Q8VEJ3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dkk4Q8VEJ3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dkk4Q8VEJ3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.2 ms