Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pdcl3Q8BVF2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdcl3Q8BVF2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms