Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zbtb40Q6PCS8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zbtb40Q6PCS8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms