Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Knl1Q66JQ7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Knl1Q66JQ7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Knl1Q66JQ7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Knl1Q66JQ7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Knl1Q66JQ7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Knl1Q66JQ7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Knl1Q66JQ7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Knl1Q66JQ7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Knl1Q66JQ7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Knl1Q66JQ7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Knl1Q66JQ7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Knl1Q66JQ7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Knl1Q66JQ7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Knl1Q66JQ7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Knl1Q66JQ7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Knl1Q66JQ7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Knl1Q66JQ7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Knl1Q66JQ7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Knl1Q66JQ7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Knl1Q66JQ7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Knl1Q66JQ7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Knl1Q66JQ7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Knl1Q66JQ7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Knl1Q66JQ7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Knl1Q66JQ7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Knl1Q66JQ7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Knl1Q66JQ7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Knl1Q66JQ7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Knl1Q66JQ7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Knl1Q66JQ7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Knl1Q66JQ7 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Knl1Q66JQ7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Knl1Q66JQ7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Knl1Q66JQ7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Knl1Q66JQ7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Knl1Q66JQ7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Knl1Q66JQ7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Knl1Q66JQ7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Knl1Q66JQ7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Knl1Q66JQ7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Knl1Q66JQ7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Knl1Q66JQ7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Knl1Q66JQ7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Knl1Q66JQ7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Knl1Q66JQ7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Knl1Q66JQ7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Knl1Q66JQ7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Knl1Q66JQ7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Knl1Q66JQ7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Knl1Q66JQ7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Knl1Q66JQ7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Knl1Q66JQ7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Knl1Q66JQ7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Knl1Q66JQ7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Knl1Q66JQ7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Knl1Q66JQ7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Knl1Q66JQ7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Knl1Q66JQ7 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Knl1Q66JQ7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Knl1Q66JQ7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Knl1Q66JQ7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Knl1Q66JQ7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Knl1Q66JQ7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Knl1Q66JQ7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Knl1Q66JQ7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Knl1Q66JQ7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Knl1Q66JQ7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Knl1Q66JQ7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Knl1Q66JQ7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Knl1Q66JQ7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Knl1Q66JQ7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Knl1Q66JQ7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Knl1Q66JQ7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Knl1Q66JQ7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Knl1Q66JQ7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Knl1Q66JQ7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Knl1Q66JQ7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Knl1Q66JQ7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Knl1Q66JQ7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Knl1Q66JQ7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Knl1Q66JQ7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Knl1Q66JQ7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Knl1Q66JQ7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Knl1Q66JQ7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Knl1Q66JQ7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Knl1Q66JQ7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Knl1Q66JQ7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Knl1Q66JQ7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Knl1Q66JQ7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Knl1Q66JQ7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Knl1Q66JQ7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Knl1Q66JQ7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Knl1Q66JQ7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Knl1Q66JQ7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
Knl1Q66JQ7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
Knl1Q66JQ7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Knl1Q66JQ7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Knl1Q66JQ7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Knl1Q66JQ7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms