Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lmod2Q3UHZ5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lmod2Q3UHZ5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Lmod2Q3UHZ5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Lmod2Q3UHZ5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lmod2Q3UHZ5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lmod2Q3UHZ5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lmod2Q3UHZ5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Lmod2Q3UHZ5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Lmod2Q3UHZ5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Lmod2Q3UHZ5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Lmod2Q3UHZ5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Lmod2Q3UHZ5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Lmod2Q3UHZ5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Lmod2Q3UHZ5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Lmod2Q3UHZ5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Lmod2Q3UHZ5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Lmod2Q3UHZ5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Lmod2Q3UHZ5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Lmod2Q3UHZ5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Lmod2Q3UHZ5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Lmod2Q3UHZ5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lmod2Q3UHZ5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lmod2Q3UHZ5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lmod2Q3UHZ5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lmod2Q3UHZ5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lmod2Q3UHZ5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lmod2Q3UHZ5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lmod2Q3UHZ5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lmod2Q3UHZ5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lmod2Q3UHZ5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lmod2Q3UHZ5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Lmod2Q3UHZ5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lmod2Q3UHZ5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lmod2Q3UHZ5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lmod2Q3UHZ5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lmod2Q3UHZ5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lmod2Q3UHZ5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lmod2Q3UHZ5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lmod2Q3UHZ5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lmod2Q3UHZ5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lmod2Q3UHZ5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lmod2Q3UHZ5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lmod2Q3UHZ5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lmod2Q3UHZ5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lmod2Q3UHZ5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lmod2Q3UHZ5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lmod2Q3UHZ5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Lmod2Q3UHZ5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lmod2Q3UHZ5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lmod2Q3UHZ5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lmod2Q3UHZ5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lmod2Q3UHZ5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lmod2Q3UHZ5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lmod2Q3UHZ5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lmod2Q3UHZ5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Lmod2Q3UHZ5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lmod2Q3UHZ5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lmod2Q3UHZ5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lmod2Q3UHZ5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lmod2Q3UHZ5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lmod2Q3UHZ5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lmod2Q3UHZ5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lmod2Q3UHZ5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lmod2Q3UHZ5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lmod2Q3UHZ5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lmod2Q3UHZ5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lmod2Q3UHZ5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lmod2Q3UHZ5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lmod2Q3UHZ5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lmod2Q3UHZ5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Lmod2Q3UHZ5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Lmod2Q3UHZ5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Lmod2Q3UHZ5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Lmod2Q3UHZ5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Lmod2Q3UHZ5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Lmod2Q3UHZ5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Lmod2Q3UHZ5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Lmod2Q3UHZ5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Lmod2Q3UHZ5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lmod2Q3UHZ5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lmod2Q3UHZ5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lmod2Q3UHZ5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lmod2Q3UHZ5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lmod2Q3UHZ5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lmod2Q3UHZ5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lmod2Q3UHZ5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lmod2Q3UHZ5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lmod2Q3UHZ5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lmod2Q3UHZ5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lmod2Q3UHZ5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lmod2Q3UHZ5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lmod2Q3UHZ5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lmod2Q3UHZ5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lmod2Q3UHZ5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Lmod2Q3UHZ5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Lmod2Q3UHZ5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lmod2Q3UHZ5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lmod2Q3UHZ5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lmod2Q3UHZ5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.4 ms