Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MitfQ08874 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MitfQ08874 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MitfQ08874 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MitfQ08874 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MitfQ08874 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MitfQ08874 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MitfQ08874 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143.3 ms