Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Siah2Q06986 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms