Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pfdn6Q03958 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pfdn6Q03958 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms