Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa10P31310 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa10P31310 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa10P31310 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa10P31310 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa10P31310 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxa10P31310 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms