Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cnga1P29974 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cnga1P29974 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cnga1P29974 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cnga1P29974 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cnga1P29974 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cnga1P29974 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cnga1P29974 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cnga1P29974 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms