Protein–RNA interactions for Protein: O35744

Chil3, Chitinase-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chil3O35744 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chil3O35744 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Chil3O35744 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chil3O35744 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chil3O35744 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chil3O35744 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chil3O35744 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms