Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm20425E9Q035 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm20425E9Q035 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm20425E9Q035 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm20425E9Q035 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm20425E9Q035 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm20425E9Q035 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm20425E9Q035 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm20425E9Q035 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm20425E9Q035 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm20425E9Q035 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm20425E9Q035 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm20425E9Q035 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm20425E9Q035 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm20425E9Q035 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm20425E9Q035 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm20425E9Q035 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm20425E9Q035 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm20425E9Q035 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm20425E9Q035 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm20425E9Q035 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm20425E9Q035 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm20425E9Q035 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm20425E9Q035 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm20425E9Q035 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm20425E9Q035 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm20425E9Q035 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm20425E9Q035 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm20425E9Q035 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm20425E9Q035 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm20425E9Q035 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm20425E9Q035 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm20425E9Q035 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm20425E9Q035 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms