Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Col5a3Q9JLI2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Col5a3Q9JLI2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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