Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV7

Extl1, Exostosin-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Extl1Q9JKV7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Extl1Q9JKV7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Extl1Q9JKV7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Extl1Q9JKV7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Extl1Q9JKV7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Extl1Q9JKV7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Extl1Q9JKV7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Extl1Q9JKV7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Extl1Q9JKV7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Extl1Q9JKV7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Extl1Q9JKV7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Extl1Q9JKV7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Extl1Q9JKV7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Extl1Q9JKV7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Extl1Q9JKV7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Extl1Q9JKV7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Extl1Q9JKV7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Extl1Q9JKV7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Extl1Q9JKV7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Extl1Q9JKV7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Extl1Q9JKV7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Extl1Q9JKV7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Extl1Q9JKV7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Extl1Q9JKV7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Extl1Q9JKV7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Extl1Q9JKV7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Extl1Q9JKV7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Extl1Q9JKV7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Extl1Q9JKV7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Extl1Q9JKV7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Extl1Q9JKV7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Extl1Q9JKV7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Extl1Q9JKV7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Extl1Q9JKV7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Extl1Q9JKV7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Extl1Q9JKV7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Extl1Q9JKV7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Extl1Q9JKV7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Extl1Q9JKV7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Extl1Q9JKV7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Extl1Q9JKV7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Extl1Q9JKV7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Extl1Q9JKV7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Extl1Q9JKV7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Extl1Q9JKV7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Extl1Q9JKV7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Extl1Q9JKV7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Extl1Q9JKV7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms