Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS3

Smco4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 59 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco4Q9JIS3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Smco4Q9JIS3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smco4Q9JIS3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Smco4Q9JIS3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Smco4Q9JIS3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Smco4Q9JIS3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smco4Q9JIS3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smco4Q9JIS3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Smco4Q9JIS3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Smco4Q9JIS3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smco4Q9JIS3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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