Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Subh2bvQ9D9Z7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Subh2bvQ9D9Z7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Subh2bvQ9D9Z7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Subh2bvQ9D9Z7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Subh2bvQ9D9Z7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Subh2bvQ9D9Z7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Subh2bvQ9D9Z7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Subh2bvQ9D9Z7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Subh2bvQ9D9Z7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Subh2bvQ9D9Z7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Subh2bvQ9D9Z7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Subh2bvQ9D9Z7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Subh2bvQ9D9Z7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Subh2bvQ9D9Z7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Subh2bvQ9D9Z7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Subh2bvQ9D9Z7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Subh2bvQ9D9Z7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Subh2bvQ9D9Z7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Subh2bvQ9D9Z7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Subh2bvQ9D9Z7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Subh2bvQ9D9Z7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Subh2bvQ9D9Z7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Subh2bvQ9D9Z7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Subh2bvQ9D9Z7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Subh2bvQ9D9Z7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Subh2bvQ9D9Z7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Subh2bvQ9D9Z7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Subh2bvQ9D9Z7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Subh2bvQ9D9Z7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Subh2bvQ9D9Z7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Subh2bvQ9D9Z7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Subh2bvQ9D9Z7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Subh2bvQ9D9Z7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Subh2bvQ9D9Z7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Subh2bvQ9D9Z7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Subh2bvQ9D9Z7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Subh2bvQ9D9Z7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Subh2bvQ9D9Z7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Subh2bvQ9D9Z7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Subh2bvQ9D9Z7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Subh2bvQ9D9Z7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Subh2bvQ9D9Z7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Subh2bvQ9D9Z7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Subh2bvQ9D9Z7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Subh2bvQ9D9Z7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Subh2bvQ9D9Z7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Subh2bvQ9D9Z7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Subh2bvQ9D9Z7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Subh2bvQ9D9Z7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Subh2bvQ9D9Z7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Subh2bvQ9D9Z7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Subh2bvQ9D9Z7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Subh2bvQ9D9Z7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Subh2bvQ9D9Z7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Subh2bvQ9D9Z7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Subh2bvQ9D9Z7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Subh2bvQ9D9Z7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Subh2bvQ9D9Z7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Subh2bvQ9D9Z7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms