Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK1

Znhit3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znhit3Q9CQK1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znhit3Q9CQK1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znhit3Q9CQK1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znhit3Q9CQK1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znhit3Q9CQK1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znhit3Q9CQK1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znhit3Q9CQK1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Znhit3Q9CQK1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znhit3Q9CQK1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znhit3Q9CQK1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znhit3Q9CQK1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znhit3Q9CQK1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znhit3Q9CQK1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znhit3Q9CQK1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znhit3Q9CQK1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znhit3Q9CQK1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znhit3Q9CQK1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znhit3Q9CQK1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znhit3Q9CQK1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znhit3Q9CQK1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znhit3Q9CQK1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znhit3Q9CQK1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znhit3Q9CQK1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znhit3Q9CQK1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znhit3Q9CQK1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znhit3Q9CQK1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znhit3Q9CQK1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znhit3Q9CQK1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znhit3Q9CQK1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Znhit3Q9CQK1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Znhit3Q9CQK1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znhit3Q9CQK1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znhit3Q9CQK1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znhit3Q9CQK1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znhit3Q9CQK1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znhit3Q9CQK1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znhit3Q9CQK1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znhit3Q9CQK1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znhit3Q9CQK1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znhit3Q9CQK1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znhit3Q9CQK1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms