Protein–RNA interactions for Protein: Q99P50

Ghsr, Growth hormone secretagogue receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GhsrQ99P50 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GhsrQ99P50 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms