Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gtpbp4Q99ME9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gtpbp4Q99ME9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms