Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Knl1Q66JQ7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Knl1Q66JQ7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Knl1Q66JQ7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Knl1Q66JQ7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Knl1Q66JQ7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Knl1Q66JQ7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Knl1Q66JQ7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Knl1Q66JQ7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Knl1Q66JQ7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Knl1Q66JQ7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Knl1Q66JQ7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Knl1Q66JQ7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Knl1Q66JQ7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Knl1Q66JQ7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Knl1Q66JQ7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Knl1Q66JQ7 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Knl1Q66JQ7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Knl1Q66JQ7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Knl1Q66JQ7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Knl1Q66JQ7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Knl1Q66JQ7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Knl1Q66JQ7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Knl1Q66JQ7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Knl1Q66JQ7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Knl1Q66JQ7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Knl1Q66JQ7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Knl1Q66JQ7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Knl1Q66JQ7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Knl1Q66JQ7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Knl1Q66JQ7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Knl1Q66JQ7 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Knl1Q66JQ7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Knl1Q66JQ7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Knl1Q66JQ7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Knl1Q66JQ7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Knl1Q66JQ7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Knl1Q66JQ7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Knl1Q66JQ7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Knl1Q66JQ7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Knl1Q66JQ7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Knl1Q66JQ7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Knl1Q66JQ7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Knl1Q66JQ7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Knl1Q66JQ7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Knl1Q66JQ7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Knl1Q66JQ7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Knl1Q66JQ7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Knl1Q66JQ7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Knl1Q66JQ7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Knl1Q66JQ7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Knl1Q66JQ7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Knl1Q66JQ7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Knl1Q66JQ7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Knl1Q66JQ7 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Knl1Q66JQ7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Knl1Q66JQ7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Knl1Q66JQ7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Knl1Q66JQ7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Knl1Q66JQ7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Knl1Q66JQ7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Knl1Q66JQ7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Knl1Q66JQ7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Knl1Q66JQ7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Knl1Q66JQ7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Knl1Q66JQ7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Knl1Q66JQ7 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Knl1Q66JQ7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Knl1Q66JQ7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Knl1Q66JQ7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Knl1Q66JQ7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Knl1Q66JQ7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Knl1Q66JQ7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Knl1Q66JQ7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Knl1Q66JQ7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Knl1Q66JQ7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Knl1Q66JQ7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Knl1Q66JQ7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Knl1Q66JQ7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Knl1Q66JQ7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Knl1Q66JQ7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Knl1Q66JQ7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Knl1Q66JQ7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Knl1Q66JQ7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Knl1Q66JQ7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Knl1Q66JQ7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Knl1Q66JQ7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Knl1Q66JQ7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Knl1Q66JQ7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Knl1Q66JQ7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Knl1Q66JQ7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Knl1Q66JQ7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Knl1Q66JQ7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Knl1Q66JQ7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Knl1Q66JQ7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Knl1Q66JQ7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Knl1Q66JQ7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Knl1Q66JQ7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Knl1Q66JQ7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Knl1Q66JQ7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms