Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mdc1Q5PSV9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mdc1Q5PSV9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mdc1Q5PSV9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mdc1Q5PSV9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mdc1Q5PSV9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mdc1Q5PSV9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mdc1Q5PSV9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mdc1Q5PSV9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mdc1Q5PSV9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mdc1Q5PSV9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mdc1Q5PSV9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mdc1Q5PSV9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mdc1Q5PSV9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mdc1Q5PSV9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mdc1Q5PSV9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mdc1Q5PSV9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mdc1Q5PSV9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mdc1Q5PSV9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mdc1Q5PSV9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mdc1Q5PSV9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mdc1Q5PSV9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Mdc1Q5PSV9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mdc1Q5PSV9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Mdc1Q5PSV9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Mdc1Q5PSV9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mdc1Q5PSV9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Mdc1Q5PSV9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mdc1Q5PSV9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mdc1Q5PSV9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mdc1Q5PSV9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mdc1Q5PSV9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mdc1Q5PSV9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mdc1Q5PSV9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mdc1Q5PSV9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mdc1Q5PSV9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mdc1Q5PSV9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mdc1Q5PSV9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mdc1Q5PSV9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mdc1Q5PSV9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mdc1Q5PSV9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mdc1Q5PSV9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mdc1Q5PSV9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Mdc1Q5PSV9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mdc1Q5PSV9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mdc1Q5PSV9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mdc1Q5PSV9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mdc1Q5PSV9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mdc1Q5PSV9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mdc1Q5PSV9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mdc1Q5PSV9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mdc1Q5PSV9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mdc1Q5PSV9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mdc1Q5PSV9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mdc1Q5PSV9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mdc1Q5PSV9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mdc1Q5PSV9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mdc1Q5PSV9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Mdc1Q5PSV9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mdc1Q5PSV9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mdc1Q5PSV9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mdc1Q5PSV9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mdc1Q5PSV9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mdc1Q5PSV9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mdc1Q5PSV9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mdc1Q5PSV9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mdc1Q5PSV9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mdc1Q5PSV9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mdc1Q5PSV9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Mdc1Q5PSV9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mdc1Q5PSV9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mdc1Q5PSV9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mdc1Q5PSV9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mdc1Q5PSV9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mdc1Q5PSV9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mdc1Q5PSV9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mdc1Q5PSV9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mdc1Q5PSV9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mdc1Q5PSV9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mdc1Q5PSV9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mdc1Q5PSV9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Mdc1Q5PSV9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mdc1Q5PSV9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mdc1Q5PSV9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mdc1Q5PSV9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mdc1Q5PSV9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mdc1Q5PSV9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mdc1Q5PSV9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mdc1Q5PSV9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mdc1Q5PSV9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mdc1Q5PSV9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mdc1Q5PSV9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mdc1Q5PSV9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mdc1Q5PSV9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms