Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Nkx6-3Q3UHX8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Nkx6-3Q3UHX8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Nkx6-3Q3UHX8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nkx6-3Q3UHX8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nkx6-3Q3UHX8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nkx6-3Q3UHX8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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