Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDV8

Zfp444, Zinc finger protein 444, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp444Q3TDV8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfp444Q3TDV8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Zfp444Q3TDV8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfp444Q3TDV8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfp444Q3TDV8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfp444Q3TDV8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfp444Q3TDV8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfp444Q3TDV8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfp444Q3TDV8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfp444Q3TDV8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfp444Q3TDV8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfp444Q3TDV8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfp444Q3TDV8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfp444Q3TDV8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfp444Q3TDV8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfp444Q3TDV8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.9 ms