Protein–RNA interactions for Protein: Q38HM4

Trim63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim63Q38HM4 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim63Q38HM4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim63Q38HM4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim63Q38HM4 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim63Q38HM4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim63Q38HM4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim63Q38HM4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim63Q38HM4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim63Q38HM4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim63Q38HM4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim63Q38HM4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim63Q38HM4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim63Q38HM4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim63Q38HM4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim63Q38HM4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim63Q38HM4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim63Q38HM4 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim63Q38HM4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim63Q38HM4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim63Q38HM4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim63Q38HM4 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim63Q38HM4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim63Q38HM4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Trim63Q38HM4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim63Q38HM4 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim63Q38HM4 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim63Q38HM4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim63Q38HM4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim63Q38HM4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim63Q38HM4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim63Q38HM4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim63Q38HM4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim63Q38HM4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim63Q38HM4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim63Q38HM4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim63Q38HM4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim63Q38HM4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim63Q38HM4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim63Q38HM4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim63Q38HM4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim63Q38HM4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim63Q38HM4 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim63Q38HM4 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Trim63Q38HM4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim63Q38HM4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim63Q38HM4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim63Q38HM4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim63Q38HM4 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim63Q38HM4 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim63Q38HM4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim63Q38HM4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Trim63Q38HM4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Trim63Q38HM4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim63Q38HM4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim63Q38HM4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Trim63Q38HM4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim63Q38HM4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim63Q38HM4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim63Q38HM4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Trim63Q38HM4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim63Q38HM4 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim63Q38HM4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Trim63Q38HM4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim63Q38HM4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim63Q38HM4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim63Q38HM4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim63Q38HM4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim63Q38HM4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim63Q38HM4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim63Q38HM4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim63Q38HM4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim63Q38HM4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim63Q38HM4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim63Q38HM4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim63Q38HM4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim63Q38HM4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim63Q38HM4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim63Q38HM4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim63Q38HM4 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim63Q38HM4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim63Q38HM4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim63Q38HM4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim63Q38HM4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim63Q38HM4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim63Q38HM4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim63Q38HM4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim63Q38HM4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim63Q38HM4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim63Q38HM4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim63Q38HM4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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