Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MitfQ08874 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MitfQ08874 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MitfQ08874 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MitfQ08874 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MitfQ08874 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MitfQ08874 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MitfQ08874 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MitfQ08874 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms